Drupalを6.x にあげようとして大失敗した。ほんと、データが全部ふっとんだかと思った。
前々からUpdateしようと思っていて、すべてのModuleが6.xに対応していることを確認して、Upgradeのやり方のVideoCast などもみていたのに。
原因はさくらインターネットサーバのMySQLのバージョンが4.0.27と古いこと。Drupal6.xは少なくとも4.1以上のMySQLを要求する。Drupalのファイルを全部入れ替えてupdate.phpを実行したところいつまでたっても終わらないので、いっそのことInstallしてやろうと思ったら、そこで初めてわかった。
バックアップしておいたMySQLのデータをリストアして、なんとか事なきを得た。
(追記)2009年春にさくらインターネットのMySQLが5.1になり、Drupalを6にあげることができた。